La légendaire Cité d'Atlantis qui a fait réver bien des générations vous est désormais accessible. Depuis bientôt 3 ans, le SGC a envoyé dans la galaxie de Pégase une expédition internationale avec à sa tête le Dr Elizabeth Weir pour retrouver la citée. Elle est secondée par le Lt colonel John Sheppard qui est le chef militaire de la base.

Au cour des deux premières années, l'équipe du affronter de nombreux ennemis dont les Wraiths, leur principal ennemi qu'ils ont réveillés, les Genis, malgré la faible entente depuis le coup d'état de Ladon, et plus récemment les Asurans, Réplicateurs crées par les Anciens pour détruire les Wraiths. Mais ils ont aussi rencontré de nombreux alliés comme Teyla et son peuple, les Athosiens.
Sur Terre, la menace Ori a été neutralisé et le nouveau vaisseau terrien, l'Apollo a été affecté à Atlantis.
Le RPG commence après l'épisode 'Le monde réel' (3x06). Les Asurans viennent de découvrir l'existence des membres de l'expédition Atlantis. Ces derniers viennent tout juste de rencontrer les Travelers, un peuple très avancé qui a survécut aux sélections des Wraiths.

Avec leurs nouveaux alliés, les membres d'Atlantis continuent l'exploration des planètes de Pégase à la recherche de technologies laissées par les Anciens et coninuent également leur combat contre les Wraiths et bientôt les Asurans.

Pénétrer dans cette prodigieuse galaxie et choisissez votre camp pour écrire votre histoire.